研究院实验室建筑面积1000平米，分设有机分析、分子生物学、重金属检测、废弃物资源化利用、生态环境工程、农业信息化等子实验室，现有仪器设备200余台(套)，价值1000余万元，包括超高效液相色谱仪、气相色谱仪、电感耦合等离子体发射光谱仪、原子荧光分析仪、原子吸收分光光度计、全自动智能化学分析仪、智能化学发光凝胶成像系统、荧光定量PCR等先进大型仪器设备，为科学研究、平台建设、人才培养、社会服务奠定了坚实基础。